契稅條例對於不動產交換，採「分別計徵」之原則，此題涉及契稅稅基、稅率、稅額之計算，以及怠報金（即逾期申報之加徵金）之認定。茲分項申論如下：
（一）交換契稅之法律性質與稅基認定
依契稅條例第2條第1項規定：「不動產之買賣、承典、交換、贈與、分割或因占有而取得所有權者，均應申報繳納契稅。但在開徵土地增值稅區域之土地，免徵契稅。」可知交換房屋（房屋本體未課土地增值稅）即為契稅之課稅標的。
復依同條例第5條第1項：「交換契稅，以交換時雙方各取得不動產之契價為計徵基礎，由雙方各按其取得不動產之契價計算稅額。」第6條：「契稅應由買受人、典權人、承受人、受贈人、分割人或占有人申報納稅。」交換契稅，乃由交換雙方分別申報、分別計徵，非以差額一次計徵。
至於「契價」之認定，依契稅條例第13條規定：「第二條所列各項契稅之取得契價，以當地不動產評價委員會評定之標準價格為準。但依第十一條取得不動產之移轉價格低於評定標準價格者，從其移轉價格。」本題既已給定甲、乙房屋之評定標準價格，自應以該標準價格為契價。
（二）甲應納契稅之計算
甲將其原有房屋（評定標準價格60萬元）交換取得乙之房屋（評定標準價格100萬元），甲為「取得不動產」之一方，應就其新取得之不動產計徵契稅。
契稅條例第3條第1項第3款規定，交換契稅之稅率為2%。
甲應納契稅 ＝ 100萬元 × 2％ ＝ 2萬元（新台幣，下同）。
至於甲另以現金補貼乙差額40萬元一節，因該現金補貼係用以補足房屋價值之差額，並非另一筆不動產移轉，故不另計契稅；惟若實際移轉價格（即補貼數額加原房屋契價）低於評定標準價格，依第13條但書，仍以評定標準價格為準。本題甲取得之房屋評定價格為100萬元，最高即以此為稅基。
（三）乙應納契稅之計算
乙將其原有房屋（評定標準價格100萬元）交換取得甲之房屋（評定標準價格60萬元），乙係取得不動產之一方，亦應就所取得之契價計徵契稅。
乙應納契稅 ＝ 60萬元 × 2％ ＝ 1萬2千元。
值得注意者，乙雖另收受現金補償40萬元，惟該補償款並非取得不動產之對價，僅係交換差額之找補，依第5條第1項之規定，仍以乙所取得不動產之契價（60萬元）為計徵基礎，不應將補貼額自契價中扣除或加計。
（四）申報期限與怠報金之認定
依契稅條例第16條第1項規定：「納稅義務人應於不動產買賣、承典、交換、贈與、分割契約成立之日起，或因占有而依法申請為所有人之日起三十日內，填具契稅申報書表，檢附公定格式契約書及有關文件，向當地主管稽徵機關申報契稅。」
本題契約於102年4月1日成立，依第16條，申報期限為30日，即至102年5月1日屆滿（同條第2項另定有展延規定，茲略）。
復依契稅條例第24條規定：「納稅義務人不依規定期限申報者，每逾三日，加徵應納稅額1%之怠報金，最高以應納稅額為限。但不得超過1萬5千元。」
1. 甲於5月5日申報：甲已逾期申報。自5月2日起算，5日當日已逾4日，依「每逾三日加徵1％」之規定，逾期4日已超過1個3日週期（即0至3日為1個週期、4至6日為第2週期），故應加徵2％之怠報金。
甲怠報金 ＝ 應納稅額2萬元 × 2％ ＝ 400元（不超過1萬5千元上限）。
2. 乙於5月7日申報：乙逾期6日，已涵蓋2個3日週期，故加徵2％之怠報金。
乙怠報金 ＝ 應納稅額1萬2千元 × 2％ ＝ 240元。
說明：第24條所謂「每逾三日加徵1％」，於實務上向採「滿三日加徵一次」之計算方式（參財政部函釋意旨）；逾期1至3日加徵1％、逾期4至6日加徵2％，依此類推，最高不得超過應納稅額，且總額不得超過1萬5千元。
（五）結論
綜上所述，甲、乙交換房屋，因雙方均屬取得不動產之人，分別構成契稅之納稅義務人。甲應納契稅2萬元，乙應納契稅1萬2千元；又契約於102年4月1日成立，法定申報期限至5月1日，甲於5月5日申報、乙於5月7日申報，均已逾期，應分別加徵怠報金400元及240元。地政士於協助當事人辦理交換登記時，宜提醒當事人注意契稅條例第16條30日之申報期限，避免增加無謂之怠報負擔，並善用同條例所提供之便民申報管道，以維權益。